Also zunächst mal: dass du beim Platinenwechsel das Bild neu einstellen musst oder auch die Spannung nachregulieren musst ist durchaus normal.
Zum Tonproblem:
die doofe Frage zuerst
, an den Lautstärkepotis hast du schon rumgetrudelt?
Sag mal, ist deine MAK etwa direkt mit NeoGeo Anschluss versehen oder benutzt du dafür einen extra Adapter? Was für'n Neo Geo hast du, mit einem oder mehreren Modulschächten?
Wenn nämlich deine MAK anstatt mit Jamma (Mono) mit dem leicht abweichenden NeoGeo Pinout (Stereo) versehen ist dann fehlt dir bei Anschluss der Konami Platinen der Audio GND weil bei Neo Geo an dem entsprechenden Pin der zweite Stereokanal anliegt.